Hewan endemik Indonesia adalah hewan-hewan yang hanya ditemukan di Indonesia dan tidak ditemukan di tempat lain. Bahkan tidak sedikit satwa endemik ini hanya ditemukan di satu pulau atau wilayah tertentu di Indonesia saja. Endemisme merupakan gejala yang dialami oleh organisme untuk menjadi unik pada satu lokasi geografi tertentu, seperti pulau, lungkang (niche), negara, atau zona ekologi tertentu. Untuk dapat dikatakan endemik, spesies hewan harus ditemukan hanya di suatu tempat tertentu dan tidak ditemukan di tempat lain. Sehingga hewan yang masuk daftar endemik ini hanya dipunyai Indonesia saja. Indonesia adalah negara dengan endemisme (tingkat endemik) yang tinggi. Diperkirakan terdapat lebih dari 165 jenis mamalia, 397 jenis burung, lebih dari 150 reptilia, dan lebih dari 100 spesies ampibi yang tercatat endemik di Indonesia. Daftar hewan endemik Indonesia ini sebagian besar saya ambil dari artikel sebelumnya tentang Binatang (Fauna) Endemik Indonesia. Berikut daftar binatang (hewan) endemik yang terdapat di Indonesia lengkap dengan nama latin dan daerah sebarannya:

Anoa dataran rendah (Bubalus depressicornis) endemik Sulawesi. 

Anoa Pegunungan (Bubalus quarlesi) di Sulawesi.

Babirusa (Babyrousa babyrussa) di Sulawesi.

Badak Bercula Satu atau badak jawa (Rhinoceros sondaicus) di Jawa.

Badak Sumatra (Dicerorhinus sumatrensis) endemik di Sumatera.

Bajing Palawan

(Sundasciurus juvencus) Bali dan Sumatera.

Bajing Tanah (Lariscus hosei) endemik pulau Kalimantan.

Bajing Telinga Botol

(Callosciurrus adamsi) endemik Kalimantan.

Banteng (Bos javanicus) hewan endemik Jawa.

Bekantan atau Kera hidung panjang (Nasalis larvatus) endemik Kalimantan.

Beruk Mentawai (Macaca pagensis) endemik Kepulauan Mentawai.

Burung Anis sulawesi (Cataponera turdoides) di Sulawesi.

Burung Beo Nias (Gracula religiosa robusta) endemik pulau Nias, Sumatera.

Burung Elang Flores (Spizaetus floris) endemik Flores.

Burung Bidadari Halmahera (Semioptera wallacii) Halmahera, Maluku Utara.

Burung Elang Jawa (Spizaetus bartelsi) di Jawa.

Burung Cenderawasih (Paradisea sp.) di Papua.

Burung Celepuk Siau (Otus siaoensis) pulau Siau, Sulawesi Utara.

Burung Cerek Jawa (Charadrius javanicus) di Jawa.

Burung Kakatua Putih (Cacatua alba) Maluku Utara. 

Kakatua putih (Cacatua alba) endemik Maluku Utara

Burung Madu Sangihe (Aethopyga duyvenbodei) Sangihe, Sulawesi Utara.

Burung Maleo (Macrocephalon maleo) di Sulawesi.

Burung Rangkong (Buceros rhinoceros) di Kalimantan.

Burung Sempidan Kalimantan (Lophura bulweri) di Kalimantan.

Burung Trulek Jawa (Vanellus macropterus) pulau Jawa.

Burung Tokhtor Kalimantan (Carpococcyx radiceus) Kalimantan.

Burung Tokhtor Sumatera (Carpococcyx viridis) di Sumatera.

Harimau Sumatera (Panthera tigris sumatrae) di Sumatera.

Jalak bali (Leucopsar rothschild) hewan endemik Bali.

Kadal Coklat Kalimantan (Lanthanotus borneensis) di Kalimantan.

Kambing Hutan Sumatera (Capricornis sumatraensis sumatraensis) di Sumatera.

Kancil Jawa (Tragulus javanicus) endemik Jawa.

Kanguru Pohon Mantel Emas

(Dendrolagus pulcherrimus) di Papua.

Kasuari Gelambir Tunggal (Casuarius unappendiculatus) di Papua.

Kasuari Kerdil (Casuarius bennetti) endemik Papua.

Katak Tanpa Paru-Paru (Barbourula kalimantanensis) Kalimantan.

Kelelawar Berjenggot Coklat dan Ekor Selubung (Taphozous achates) di Nusa Penida, Bali.

Kelinci belang sumatera (Nesolagus netscheri) endemik Sumatera.

Kera Belanda (Nasalis larvatus) di Kalimantan.

Kera hitam sulawesi (Macaca nigra) endemik Sulawesi Utara.

Kodok Darah (Leptophryne cruentata) endemik Jawa Barat.

Kodok Pohon Ungaran (Philautus jacobsoni) endemik Jawa Tengah.

Komodo (Varanus komodoensis) di Nusa Tenggara Timur (P. Komodo).

Kucing Bakau (Prionailurus bengalensis javanensis) di Jawa.

Kucing Merah (Felis badia) endemik pulau Kalimantan.

Kukang Jawa (Nycticebus javanicus) pulau Jawa.

Kura-kura Berleher Ular (Chelodina mccordi) di Pulau Rote, NTT.

Kuskus Beruang (Ailurops ursinus) Sulawesi.

Kuskus Gebe (Phalanger alexandrae) Pulau Gebe Maluku Utara.

Kuskus Matabiru (Phalanger matabiru) Pulau Ternate dan Tidore Maluku.

Kuskus Kerdil (Strigocuscus celebensis) endemik pulau Sulawesi.

Kuskus Obi (Phalanger rothschildi) Pulau Obi Maluku.

Landak Jawa (Hystrix javanica) endemik Jawa.

Landak Sumatera (Hystrix sumatrae) endemik Sumatera.

Landak Kalimatan (Thecurus crassispinis) endemik Kalimantan.

Lutung Dahi Putih (Presbytis frontata) endemik Kalimantan.

Lutung jawa (Trachypithecus auratus) endemik Jawa.

Lutung Merah (Presbytis rubicunda) satwa endenik Kalimantan.

Macan Dahan (Neofelis diardi) endemik Sumatera dan Kalimantan. 

Macan Dahan hewan endemik Kalimantan dan Sumatera

Macan tutul jawa (Panthera pardus melas) di Jawa.

Monyet Ekor Babi (Simias concolor) kepulauan Mentawai.

Musang Sulawesi (Macrogalidia musschenbroeckii) di Sulawesi.

Orangutan sumatera (Pongo abelli) di Sumatera.

Orang Utan Kalimantan (Pongo pygmaeus) di Kalimantan.

Owa jawa (Hylobates moloch) fauna endemik Jawa.

Owa-owa (Hyllobates muelleri) di Kalimantan.

Rusa bawean (Axis kuhlii) endemik pulau Bawean.

Rusa timor (Cervus timorensis) endemik Bali, Irian Jaya.

Siamang (Hylobates syndactylus) di Sumatera.

Surili (Presbytis comata) di Jawa.

Tarsius Bangka atau Mentilin (Tarsius bancanus) di Sulawesi Utara.

Tarsius Peleng (Tarsius pelengensis) pulau Peleng, Sulawesi.

Tarsius Pygmy atau Pygmy Tarsier (Tarsius pumilus) Sulawesi.

Tarsius Sulawesi (Tarsius tarsier) Sulawesi.

Tupai Mentawai (Tupaia chrysogaster) Kepulauan Mentawai.

Semoga endemisme (tingkat endemik) hewan yang tinggi yang dipunyai Indonesia ini mampu kita lestarikan sebagai warisan buat anak cucu kita.